Coi suoi quasi quattro chilometri di scaffalature, gli oltre settanta fondi e le circa 10.000 unità archivistiche, l’Archivio Arcivescovile è di fatto uno dei maggiori per sviluppo in metri lineari della città di Bologna. I fondi sono per lo più di ambito ecclesiastico; come di norma negli archivi diocesani, vi si conservano le carte legate all’attività dell’arcivescovo (Mensa, Segreteria, etc.), della curia (Cancellerie, Fori, etc.) e del capitolo della cattedrale (Archivio Capitolare, Fondo Musicale, etc.). Sono inoltre custoditi archivi di parrocchie (per lo più soppresse), di persona (ad esempio il fondo Breventani, il fondo Baroni e gli archivi Acquaderni) e perfino d’impresa (L’Avvenire d’Italia). Altra tipologia di fondi è quella formatasi nel corso del tempo a partire da materiali eterogenei o di provenienza incerta (Miscellanee Vecchie e Ricuperi). Fra i fondi più consultati dagli studiosi meritano di essere ricordati anche i Registri battesimali e le Visite Pastorali. Per maggiori informazioni cfr. M. Fanti, L’Archivio Generale Arcivescovile di Bologna. Notizie storiche. Elenco dei fondi archivistici. Avvertenze utili per le ricerche, [Bologna, 1999].
Il seguente elenco presenta i fondi consultabili ordinati alfabeticamente, con l’indicazione dell’eventuale presenza di strumenti di corredo consultabili in sala studio (quelli consultabili anche online sono accessibili attraverso il link).
| Denominazione | Strumenti di corredo |
| Amministrazione ecclesiastica del cimitero di Bologna | elenco di consistenza |
| Archivi Acquaderni (vedi anche Strumenti di corredo) | inventario |
| Archivio capitolare (vedi anche Strumenti di corredo) | inventario a stampa |
| Archivio Consorziale del clero urbano | inventario a stampa |
| Archivio dell’Archivio Generale Arcivescovile | inventario |
| Archivio Pini | inventario |
| UTOA (Ufficio Tecnico Organizzativo Arcivescovile) | no |
| Azienda rogazioni minori | no |
| Azienda vicariati e cappellanie | inventario |
| Baroni Augusto | inventario |
| Biblioteca dei sagristi e dei cerimonieri | repertorio |
| Campioni beneficiari | inventario |
| Cancelleria civile – Affari civili | inventario |
| Cancelleria civile – Oggetti ecclesiastici | inventario |
| Cancelleria ecclesiastica | inventario |
| Cancellerie vecchie (nell’inventario “varie”) | inventario |
| Carte ufficio Cassoli | inventario |
| Censimento 1847 | inventario |
| Circolo Mario Fani | inventario |
| Collezione dei testamenti e delle denunce dei legati pii | inventario |
| Compagnia del SS. Sacramento della Cattedrale | elenco di consistenza |
| Congregazione consultiva per i luoghi pii | inventario |
| Congregazione dei deputati ecclesiastici | inventario |
| Congregazione dei poveri di S. Rocco | elenco di consistenza |
| Congregazione delle Orsoline | inventario |
| Congregazione di Carità e Commissione di stralcio | inventario |
| Congresso Eucaristico Diocesano 1987 | no |
| Congresso Eucaristico Nazionale 1997 | no |
| Curia Arcivescovile | no |
| Delegazione per il culto | inventario |
| Eredità giacente Giovannini Paola (carte Bianconi) | elenco di consistenza |
| Fabbrica di S. Pietro in Bologna | no |
| Fondo musicale della cattedrale | repertorio |
| Foro arcivescovile | inventario |
| Foro arcivescovile e governo di Cento | inventario |
| Foro criminale arcivescovile (Tribunale ecclesiastico) | inventario |
| Istrumenti | inventario |
| L’Avvenire d’Italia | no |
| Legio Mariae | inventario |
| Matrimoni e doti | inventario |
| Mensa Arcivescovile | no |
| Miscellanee vecchie | inventario |
| Monastero del Corpus Domini o Archivio della Beata Caterina | inventario |
| Parrocchia di san Pietro in Bologna | no |
| Parrocchie della diocesi | elenco di consistenza |
| Parrocchie soppresse della città | inventario a stampa |
| Patrimonio ex gesuitico | inventario |
| Pio Cumulo della Misericordia | no |
| Priorato di S. Maria di Camerlata o di Ripa di Sasso | inventario |
| Pro-vicariati e vicariati generali | inventario |
| Raccolta Breventani | inventario |
| Raccolta degli statuti | inventario a stampa |
| Raccolta dei libri liturgici della cattedrale | catalogo a schede |
| Raccolta Oppizzoni | inventario a stampa |
| Registri battesimali della Cattedrale | inventario |
| Restauro della cattedrale 1997 | no |
| Ricuperi attuariali | inventario |
| Ricuperi beneficiari | inventario |
| Ricuperi vari | inventario |
| Ruoli parrocchiali | no |
| Scuola dei Confortatori (vedi anche Strumenti di corredo) | inventario |
| Segreteria arcivescovile | inventario |
| Seminario Arcivescovile e aziende unite | elenco di consistenza |
| Società femminile di S. Vincenzo de’ Paoli | inventario |
| Società maschile di S. Vincenzo de’ Paoli | inventario |
| Stampe | inventario |
| Succollettoria degli spogli | no |
| Tabularia della Metropolitana | inventario |
| Tribunale del Sant’Uffizio | inventario |
| Tribunale della Rev. Fabbrica di S. Pietro in Roma: Commissaria di Bologna | inventario |
| Università dei Servitori | inventario |
| Visite pastorali | inventario a stampa |
